世界上没有十全十美的事物，生物柴油也有其自身的不足。有些与燃料自身有关，而更多的是与整体环境有关。

生物柴油本身的问题之一是燃油排放中氮氧化物的增加。通常，在柴油燃料制作过程中，在降低排放中颗粒物含量的同时，就会相应增加氮氧化合物，这会导致形成烟雾。尽管可以通过调整发动机本身来解决一些此类问题，但这有时是不可行的。目前人们正在研究相关技术，以降低生物柴油排放中的氮氧化物含量。

另一个问题是生物柴油作为溶剂的行为。尽管这一特性有其有用之处，但它同时又是一把双刃剑。有些旧式柴油车辆（如 1992 年以前生产的车辆）使用更高浓度的生物柴油时可能发生堵塞。由于它具有疏通发动机中沉积物的能力（可能是旧柴油燃料造成的），生物柴油可能会因刚刚疏通的沉积物导致燃油滤清器发生堵塞。因此，生物柴油制造商建议在改用高浓度生物柴油混合物之后不久，就应更换燃油泵。此外，旧燃油系统中的零部件也可能发生退化。除了燃油系统中的沉积物之外，生物柴油还会损坏橡胶零件。旧系统中的有些零件，如燃油管和燃油泵密封件，可能会由于它们的橡胶或橡胶类成分而损坏。这通常是通过更换这些部件来修复的。尽管许多制造商已将生物柴油包含在保修服务中，但问题的潜在性仍然存在。有关生物柴油和车辆保修服务的更多信息，请查看生物柴油标准。

同时，在有些发动机中，燃油经济性和动力可能会发生轻微的降低。平均而言，动力会降低 10 ％。换言之，使用 1.1 升的生物柴油可实现使用 1 升标准柴油所达到的动力性。

生物柴油的主要缺点与整体环境有关，即市场和相关物流方面。当然，最重要的是成本问题。 根据美国国家环保局的资料，纯生物柴油 (B100) 每升费用从 0.52 美元到 0.79 美元不等，而 B20 混合物比标准柴油每升平均多花费 8 美分到 11 美分。这完全取决于所用给料和市场情况等变量。

另一个比较重要的问题是数量和可用性。在美国，尽管没有必要让所有 50 个州都可以生产生物柴油，但在所有州内必须均有销售。获得生物柴油有三种主要方法，每种方法适用于特定类型的消费者。生物柴油可以直接从供应商、石油经销商、或公用泵处购买。目前共有 19 名美国生物柴油委员会成员在美国境内从事生物柴油的生产和销售工作。要了解在美国如何购买生物柴油，请联系美国生物柴油委员会。另外，可替代燃油数据中心具有搜索功能，使您可以查找城市或州的加油站。

有关定位美国境外生物柴油站的信息，请联系当地的生物燃油机构。

那么，我们的产量是多少呢？由于存在大量不同的生产商（即联邦、私人、工业公司）和谷物原料，所以很难给出一个确切的数字。目前，美国每年约生产 2.8 亿升的生物柴油（美国生物柴油委员会）。此产量是灵活的，可以根据需求增加或减少。

生物柴油的未来

不管生物柴油是否能成为最受关注的技术，它都必定会成为一项不断发展的长期工作。

目前，最大的生物柴油市场是运输车队车辆。根据美国生物柴油委员会的信息，美国境内共有超过 100 个这样的车队在使用生物柴油，包括联邦和公共组织，如：美国邮政服务公司、美国空军、美国陆军、美国国家航空航天局、美国能源部、迪克能源公司和佛罗里达电力和照明公司。许多公共运输服务部门也希望使用生物柴油，以补充石油使用。城市公共汽车，如辛辛那提地铁，也使用生物柴油。潜在未来目标包括海运和农业应用，以及住宅供热领域。

随着公众关注度的提高，生物柴油和生物燃料很可能成为大家茶余饭后讨论的话题。同时，政府支持也在增强，紧随 1998 年《能源政策法案》修订版等立法之后，可替代燃料源将在不远的将来成为一种必需品。